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DLin-DMA的衍生發(fā)展史

更新時(shí)間:2023-09-06   點(diǎn)擊次數(shù):770次

DLin系列

本實(shí)驗(yàn)中,研究人員采用了一種合理的方法來(lái)設(shè)計(jì)陽(yáng)離子脂質(zhì),并制備用于遞送小干擾RNA(siRNA)的配方。以穩(wěn)定核酸脂質(zhì)顆粒(SNALP)的關(guān)鍵脂質(zhì)成分1,2-二甲醇氧基-3-二甲基氨基bing烷(DLinDMA)為例,研究人員利用所提出的可電離陽(yáng)離子脂質(zhì)的體內(nèi)作用機(jī)制來(lái)指導(dǎo)設(shè)計(jì)具有優(yōu)異遞送能力的基于DLinDMA結(jié)構(gòu)拓展的脂質(zhì)。通過(guò)篩選后,對(duì)性能好的脂質(zhì)(DLin-KC2-DMA),進(jìn)行了SNALP配制和表征,并在嚙齒類動(dòng)物和非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物中分別在低至0.01 mg/kg和0.1 mg/kg的siRNA劑量下,證明具有體內(nèi)活性。研究發(fā)現(xiàn),DLin-KC2-DMA介導(dǎo)的基因沉默比以前關(guān)于體內(nèi)內(nèi)源性肝臟基因沉默的報(bào)道有了實(shí)質(zhì)性的改進(jìn)。

表1.1 基于DLin-DMA的結(jié)構(gòu)設(shè)計(jì)

圖1.1. 新型陽(yáng)離子脂質(zhì)的體內(nèi)評(píng)價(jià)

(a). DLinDAP的沉默活性(▼), DLinDMA(▲), DLin-K-DMA(■) 和DLin KC2-DMA(●)在小鼠FVII模型中的篩選。所有LNP siRNA系統(tǒng)都是使用預(yù)成型囊泡(PFV)方法制備的,由可電離的陽(yáng)離子脂質(zhì)、DSPC、膽固醇和PEG脂質(zhì)(40:10:40:10mol/mol)組成,F(xiàn)VII siRNA/總脂質(zhì)的比例約為0.05(wt/wt)。
(b). 頭群擴(kuò)展對(duì)DLin-K-DMA活性的影響。DLin-K-DMA(■)在DMA頭基和縮酮環(huán)連接體之間添加了額外的亞甲基,以生成DLin-KC2-DMA(●),DLin-KC3-DMA(▲)和DLin-KC4-DMA(▼)在小鼠因子VII模型中評(píng)估每種脂質(zhì)的制劑活性。

表1.2 含有新型脂質(zhì)的LNPs的生物物理參數(shù)和體內(nèi)活性

鑒于正電荷在指導(dǎo)脂質(zhì)設(shè)計(jì)的作用機(jī)制假說(shuō)中的重要性,在DLin-K-DMA作為新的基準(zhǔn)脂質(zhì)的綜述中研究了胺基頭基結(jié)構(gòu)變化的影響。進(jìn)行了一系列頭基修飾、表征和測(cè)試,以探索大小、酸離解常數(shù)和可電離基團(tuán)數(shù)量的影響(補(bǔ)充合成2和補(bǔ)充表2)。所測(cè)試的pai嗪基、ma啉基、三甲基氨基或雙二甲基氨基修飾并不優(yōu)于DLin-K-DMA的基準(zhǔn)二甲基氨基頭基。作為附加參數(shù),通過(guò)引入額外的亞甲基來(lái)改變二甲基氨基和二氧wu環(huán)連接體之間的距離。該距離可以影響胺頭基的pKa以及電荷呈現(xiàn)相對(duì)于脂質(zhì)雙層界面的距離和柔性。相對(duì)于DLin-K-DMA,將單個(gè)額外的亞甲基插入頭部基團(tuán)(DLin-KC2-DMA)產(chǎn)生效力的顯著增加。在FVII模型中,這種脂質(zhì)的ED50約為0.1 mg/kg,使其效力比DLin-K-DMA高4倍,比DLinDMA基準(zhǔn)高10倍。然而,具有額外亞甲基的系鏈的進(jìn)一步延伸顯著降低了活性,DLin-KC3-DMA的ED50約為0.6 mg/kg,DLin-KC4-DMA的ED50>3 mg/kg。

圖1.2. 基于DLin-K-DMA,延長(zhǎng)頭部基團(tuán)碳鏈長(zhǎng)度對(duì)粒徑及ED50的影響

圖1.3. KC2-SNALP對(duì)嚙齒類動(dòng)物和非人類靈長(zhǎng)類動(dòng)物的療效

(a) 相對(duì)于在小鼠中測(cè)試的初始篩選制劑,KC2-SNALP的療效得到改善。KC2-SNALP的體內(nèi)療效(○) 與小鼠因子VII模型中未優(yōu)化的DLin-KC2-DMA篩選(即PFV)制劑(●)的結(jié)果進(jìn)行比較。數(shù)據(jù)點(diǎn)以PBS對(duì)照動(dòng)物的百分比表示,代表組平均值(n=5)±s.d.(b)KC2-SNALP在非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物中的療效。食蟹猴(每組n=3)接受0.03、0.1、0.3或1 mg/kg siTTR,或1 mg/kg在KC2-SNALP或PBS中配制的siApoB的總劑量,通過(guò)頭靜脈靜脈輸注15分鐘(5 ml/kg)。給藥后48小時(shí)對(duì)動(dòng)物實(shí)施an樂(lè)死。在肝臟樣品中測(cè)定TTR mRNA水平相對(duì)于GAPDH mRNA水平。數(shù)據(jù)點(diǎn)代表組平均值±s.d.*,P<0.05;**,P<0.005。

表1.3 含有KC2的SNALP的體內(nèi)活性

總結(jié),研究人員將一種合理的方法應(yīng)用于新型陽(yáng)離子脂質(zhì)的設(shè)計(jì),這些脂質(zhì)被篩選用于基于LNPsiRNA遞送系統(tǒng)。脂質(zhì)結(jié)構(gòu)分為三個(gè)主要功能元件:烷基鏈、連接基和頭基。以DLinDMA為起點(diǎn),通過(guò)保持其他兩個(gè)元素不變,以系統(tǒng)的方式研究了這些元素中每一個(gè)的影響。首先,建立了烷基鏈,然后改變了連接體,最后,探索了不同的頭基結(jié)構(gòu)。使用這種方法,描述了可離子化陽(yáng)離子脂質(zhì)的重要結(jié)構(gòu)-活性考慮因素,并鑒定了相對(duì)于DLinDMA基準(zhǔn)具有改進(jìn)活性的脂質(zhì)。性能好的脂質(zhì)(DLin-KC2-DMA)的SNALP制劑在嚙齒類和非人類靈長(zhǎng)類動(dòng)物中都具有良好的耐受性,并且在嚙齒類動(dòng)物中在低至0.01mg/kg的siRNA劑量下表現(xiàn)出體內(nèi)活性,并且在非人類靈長(zhǎng)目動(dòng)物中表現(xiàn)出治療顯著基因(TTR)的沉默。盡管目前的工作范圍僅限于體內(nèi)肝臟遞送,但與之前關(guān)于LNP siRNA介導(dǎo)的非人靈長(zhǎng)類動(dòng)物沉默的報(bào)道相比,這項(xiàng)工作中實(shí)現(xiàn)的TTR沉默(ED50~0.3 mg/kg)代表了活性的顯著提高

試驗(yàn)2

MC3最大限度地提高siRNA脂質(zhì)納米顆粒在體內(nèi)用于肝臟基因沉默的效力[2]

pKa的考察


圖2.1.TNS熒光法測(cè)定pKa

如圖2所示,四種可電離陽(yáng)離子脂質(zhì)的pKa的測(cè)定實(shí)例。pKa的取值,定義為在一半最大熒光強(qiáng)度下的pH值。(A). 14,pKa=4.17;(B). 52,pKa=5.73;(C). 19,pKa=6.95;(D). 48,pKa=8.12。

圖2.2. 小鼠體內(nèi)肝臟基因沉默活性與pKa的關(guān)系圖

將56個(gè)可電離陽(yáng)離子脂質(zhì)配制成LNP,并進(jìn)行ED50分析,根據(jù)它們的pKa,繪制得到圖4。有15種脂質(zhì),沒(méi)有達(dá)到ED50劑量。剩余的脂質(zhì),通過(guò)最佳擬合曲線突出顯示了具有活性的化合物,其表現(xiàn)出在6.2和6.5之間的最佳pKa

表2.1. 56種可電離陽(yáng)離子脂質(zhì)的設(shè)計(jì)及其ED50,pKa值考察



圖2.3. 小鼠肝臟基因沉默活性圖

pKa在4-8.5之間,計(jì)算質(zhì)子化/未質(zhì)子化可電離陽(yáng)離子脂質(zhì)的電離程度(%摩爾分?jǐn)?shù))。每個(gè)FVII ED50數(shù)據(jù)點(diǎn)(藍(lán)色)來(lái)源于四劑量反應(yīng)(每個(gè)劑量水平n=4只小鼠)。假設(shè)pH為7.4,在血液中攜帶正電荷的陽(yáng)離子脂質(zhì)顯示為紅色,而在pH為5.5的酸性內(nèi)涵體中不帶電的陽(yáng)離子脂質(zhì)的顯示為綠色。

圖2.4.支持pKa值作為決定可電離陽(yáng)離子脂質(zhì),體內(nèi)肝臟基因沉默活性的主導(dǎo)因素。

可電離陽(yáng)離子脂質(zhì)15、16和17的混合物使所得LNP的平均表面pKa值在5.64和6.93之間遞增移位。括號(hào)中的數(shù)字表示混合物中陽(yáng)離子脂質(zhì)的摩爾比(氨基脂質(zhì)組分)。


圖2.5.可電離陽(yáng)離子脂質(zhì)(16,DLin-MC3-DMA)的siRNA-LNP在小鼠和非人類靈長(zhǎng)類動(dòng)物中的功效。

在本研究中使用了含有50摩爾%的16(DLin-MC3-DMA)的經(jīng)過(guò)優(yōu)化后的制劑組合。相對(duì)于具有約0.005 mg.kg-1的中值有效siRNA劑量(ED50)的生理鹽水對(duì)照組,小鼠血清中的殘余FVII活性;柱狀圖代表平均值(n=5)給予食蟹猴0.03、0.1和0.3mg.kg-1劑量的靶向TTR基因的siRNA。線型圖則表示平均值(n=3),以TTR mRNA表示,相對(duì)于肝臟樣本中測(cè)定的GAPDH mRNA水平,ED50估計(jì)為<0.03 mg.kg-1。


Reference

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[2]. Jayaraman M, Ansell SM, Mui BL, Tam YK, Chen J, Du X, Butler D, Eltepu L, Matsuda S, Narayanannair JK, Rajeev KG, Hafez IM, Akinc A, Maier MA, Tracy MA, Cullis PR, Madden TD, Manoharan M, Hope MJ. Maximizing the potency of siRNA lipid nanoparticles for hepatic gene silencing in vivo. Angew Chem Int Ed Engl. 2012 Aug 20;51(34):8529-33. doi: 10.1002/anie.201203263. Epub 2012 Jul 10. PMID: 22782619; PMCID: PMC3470698.